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    酶解or超聲?看小美非接觸超聲波DNA打斷儀如何大顯身手

    2022-11-04 10:39:30  來源:上海凈信
    NGS檢測實驗中,DNA文庫構建的一步就是將DNA隨機打斷成符合各測序平臺讀長的片段相信熟悉NGS文庫構建的科研人員一定糾結過這個問題,用酶解打斷還是超聲波打斷?
     
    目前DNA打斷的*主要的方法超聲法和酶解法。但是這兩種方法在實際使用中各具優勢,需要根據實驗者自身的情況進行選擇。
    超聲波打斷法
    操作簡單,耗時短,成本低隨機片段化,無GC序列偏好剪切效果不受DNA濃度影響
    片段化結果集中度高,目的長度片段得率高
    酶切法
    實驗要求嚴格,針對不同樣本合適的片段化條件摸索不易,成本較高存在序列偏好性需要根據樣本濃度改變酶濃度,酶活性易受到溶液成分影響目標長度片段集中度較低
    超聲打斷法的優勢顯而易見常用的超聲波打斷儀分為接觸式和非接觸式相比傳統的探頭超聲波破碎儀,探頭與樣品直接接觸,一次只能處理一個樣品,實驗周期長。小美非接觸超聲波DNA打斷儀Plus系列產品可在密閉容器下進行破碎,不產生感染性飛霧,超聲探頭與樣品不接觸,避免交叉污染。對于每天要處理多個樣品或者貴重樣品的實驗室,此款儀器具有處理高通量,樣本低損耗,無交叉污染等優勢。逐漸成為ChIP(染色質免疫共沉淀)和DNA剪切研究平臺不可缺少的標準化工具。
     
    小美超聲非接觸超聲波DNA打斷儀Plus系列產品具有通量高、實驗一致性好,實驗重復性好、片段得率高等優點為二代測序DNA樣本與染色質免疫共沉淀實驗樣本前處理量身訂做應用領域包含細菌細胞破碎蛋白質抽提二代測序樣本DNA片段化霉菌孢子破碎、乳化均質加速溶解催化反應
     
     
    采用等溫、非接觸的方式對樣品進行打斷、勻漿和混合用于無菌、可超微量破碎,隔著離心管能打斷染色體。深受各大基因公司生物公司測序公司的青睞
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